金唐山善行寺位於台南市佳里區建南里，屬「三級古蹟佳里金唐殿」之後面。善行堂三寶殿（由於奉祀釋迦牟尼佛及文殊、普賢二位菩薩，所以信徒尊稱為「三寶殿」。）清朝時代，三寶殿為儒教的書房，日據初期設立公學校（國民小學）。三寶殿可稱為佳里鎮教育英才之發源地。未建寺以前，定妙和尚（俗名：陳世鈿，惻淨和尚徒弟）管理三寶殿。由其興建三寶殿兩邊廂房。後定妙和尚在麻豆創立麻豆保濟寺。（參照金唐殿善行寺沿革誌三十八頁）
清道光十六年（一八三六年），蕭壠地區之龍華派諸齋友，善行堂第一代開山：劉普洲、陳普在、洪普郎、蔡普草、羅普草、鄭普謨等人發心在在今佳里中山公園內合力捐建善行堂，即當時蕭瓏堡武將陳千總之後院庭園，日據時代被徵收改建日本神社，而佛堂被拆除。明治三十一年善行堂第二代開山：林慐懷、楊普釗、李普君、洪河治、楊啟、陳掽頭、林荖在佳里庄佳里一六九六番地，又重建善行堂，管理人邱溪(參照臺南州祠廟名鑑，相良吉哉編著)
據本寺紀錄本寺建於民前四年（西元一九○八年），由本地善信洪士、劉益、楊玉、陳掽頭、陳慐少、鄭典、陳長等七人（被稱為七家），共同發起重建佛堂，各人捐出園地店舖等，建一簡漏之佛堂於現今安西里和平街與長安街交叉口附近，已故陳天扶之宅第（現已改建高樓），而洪士死後，佛堂無人管理，致使荒廢倒塌，當時幸有一港口人士「江阿司」，邀集信眾，將佛像及骨灰整理，而借用黃祖厝崇榮堂暫借奉祀，時為民國六年（西元一九一七年）之史實。（參照金唐殿善行寺沿革誌三十一頁）
據本寺紀錄本寺建於民前四年（西元一九○八年），由本地善信洪士、劉益、楊玉、陳掽頭、陳慐少、鄭典、陳長等七人（被稱為七家），共同發起重建佛堂，各人捐出園地店舖等，建一簡漏之佛堂於現今安西里和平街與長安街交叉口附近，已故陳天扶之宅第（現已改建高樓），而洪士死後，佛堂無人管理，致使荒廢倒塌，當時幸有一港口人士「江阿司」，邀集信眾，將佛像及骨灰整理，而借用黃祖厝崇榮堂暫借奉祀，時為民國六年（西元一九一七年）之史實。（參照金唐殿善行寺沿革誌三十一頁）